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2015年10月1日から
| 総长 | 山極 壽一 |
| 理事 | 阿曽沼 慎司 |
| 理事 | 稲葉 カヨ |
| 理事 | 北野 正雄 |
| 理事 | 佐藤 直樹 |
| 理事 | 清木 孝悦 |
| 理事 | 湊 長博 |
| 文学研究科长 | 川添 信介 | 工学研究科长 | 伊藤 紳三郎 |
| 文学研究科 | 南川 高志 | 工学研究科 | 北村 隆行 |
| 文学研究科 | 平田 昌司 | 工学研究科 | 大津 宏康 |
| 教育学研究科长 | 子安 增生 | 农学研究科长 | 宮川 恒 |
| 教育学研究科 | 桑原 知子 | 农学研究科 | 縄田 栄治 |
| 教育学研究科 | 稲垣 恭子 | 农学研究科 | 天野 洋 |
| 法学研究科长 | 潮見 佳男 | 人间?环境学研究科长 | 高橋 由典 |
| 法学研究科 | 川濵 昇 | 人间?环境学研究科 | 田村 類 |
| 法学研究科 | 山本 敬三 | 人间?环境学研究科 | 東郷 雄二 |
| 経済学研究科长 | 岩本 武和 | エネルギー科学研究科长 | 塩路 昌宏 |
| 経済学研究科 | 依田 高典 | エネルギー科学研究科 | 石原 慶一 |
| 経済学研究科 | 江上 雅彦 | アジア?アフリカ地域研究研究科长 | 小杉 泰 |
| 理学研究科长 | 森脇 淳 | アジア?アフリカ地域研究研究科 | 太田 至 |
| 理学研究科 | 余田 成男 | 情报学研究科长 | 山本 章博 |
| 理学研究科 | 平野 丈夫 | 情报学研究科 | 田中 利幸 |
| 医学研究科长 | 上本 伸二 | 生命科学研究科长 | 石川 冬木 |
| 医学研究科 | 玉木 敬二 | 生命科学研究科 | 佐藤 文彦 |
| 医学研究科 | 稲垣 暢也 | 総合生存学馆长 | 川井 秀一 |
| 薬学研究科长 | 髙倉 喜信 | 総合生存学馆 | 池田 裕一 |
| 薬学研究科 | 金子 周司 | 地球环境学堂长 | 藤井 滋穂 |
| 薬学研究科 | 中山 和久 | 地球环境学堂 | 舟川 晋也 |
| 公共政策连携研究部长 | 新川 敏光 | 原子炉実験所长 | 川端 祐司 |
| 経営管理研究部长 | 河野 広隆 | 霊长类研究所长 | 平井 啓久 |
| 化学研究所长 | 時任 宣博 | 东南アジア研究所长 | 河野 泰之 |
| 人文科学研究所长 | 井波 陵一 | フィールド科学教育研究センター长 | 吉岡 崇仁 |
| 再生医科学研究所长 | 開 祐司 | 生态学研究センター长 | 中野 伸一 |
| エネルギー理工学研究所长 | 水内 亨 | 学术情报メディアセンター长 | 岡部 寿男 |
| 生存圏研究所长 | 津田 敏隆 | 地域研究统合情报センター长 | 原 正一郎 |
| 防灾研究所长 | 寶 馨 | こころの未来研究センター长 | 吉川 左紀子 |
| 基础物理学研究所长 | 佐々木 節 | 附属図书馆长 | 引原 隆士 |
| ウイルス研究所长 | 小柳 義夫 | | |
| 経済研究所长 | 溝端 佐登史 | | |
| 数理解析研究所长 | 向井 茂 | | |
| 颈笔厂细胞研究所长 | 山中 伸弥 | | |
