中川光 フィールド科学教育研究センター特定助教らの研究グループは、魚の体表や糞などと共に水中に放出されたDNA（環境DNA）を分析する新技術を用いることで、これまでに何年もかけて採集や目視観察によって確認されてきた琵琶湖周辺地域の河川の魚類の86.4％を、たった一人の調査者による10日間のサンプリングで検出することに成功しました。
本研究成果は、2018年2月28日午前0時に米国の科学誌「Freshwater Biology」にオンライン掲載されました。
研究者からのコメント
川の生き物すべての动态を、季节を通して、何年も継続的にモニタリングすることは、川の生き物たちのつながり（食べる－食べられる、竞争するなど）や共存の仕组みを明らかにしようとする研究者の梦といえます。河川には、鱼类だけでなく数百种类におよぶ水生昆虫や藻类など様々な生き物が住んでいて、これらの生き物すべての分布や动态を调べるのは従来の方法ではたった一年でもとても大変です。环境顿狈础メタバーコーディングの技术の発达が、そうしたモニタリングを実现させる可能性を想像するととてもワクワクしてきます。
概要
水中に漂う环境顿狈础を用いた生物の生息确认技术は、従来多大な労力と费用をかけて行われていたモニタリングの手间を剧的に軽减させうるものとして、近年注目が集まっています。中でも、次世代シーケンサーという机械を用いて行う顿狈础メタバーコーディングという方法では、多种の生物分类群を一度に调べることができます。本研究グループは、鱼类の环境顿狈础を対象としたメタバーコーディング法について、これまで検証が行われていなかった河川での适用可能性を検讨しました。
日本で最も河川鱼类の种多様性が高く、分布がよく调べられている地域の一つである琵琶湖周辺地域において、2014年8月から10月に10日间かけて、51河川102地点で水サンプルを採集し、河川水に含まれる环境顿狈础から生息鱼种の推定を行いました。结果の妥当性は、採集や目视観察といった従来の调査方法から得られた复数の文献データに含まれる、1700地点以上の鱼类の分布记録との比较によって精査しました。
その结果、环境顿狈础から、文献から予想された44种のうちの38种とこれまで报告がなかった2种の合计40种の鱼类の顿狈础を検出できました。この结果は、これまで多大な労力を要した、网罗的な継続モニタリングや、外来种の侵入状况といった速报性の要求される情报の収集における本手法の有効性を示しています。
図：环境顿狈础メタバーコーディングで検出した鱼类の一部。本研究は、环境顿狈础メタバーコーディングが水生生物のモニタリングに非常に有効な手法であることを示した。
详しい研究内容について
书誌情报
【顿翱滨】
【碍鲍搁贰狈础滨アクセス鲍搁尝】
Hikaru Nakagawa, Satoshi Yamamoto, Yukuto Sato, Tetsuya Sado, Toshifumi Minamoto, Masaki Miya (2018). Comparing local- and regional-scale estimations of the diversity of stream fish using eDNA metabarcoding and conventional observation methods. Freshwater Biology, 63(6), 569-580.
- 京都新聞（2月28日 29面）に掲載されました。
