飯田慶 医学研究科特定助教、武内章英 同准教授、萩原正敏 同教授らの研究グループは、RNA結合タンパク質の1つであるSFPQ(Splicing Factor Proline And Glutamine Rich)をモデルとして、「RNAの機能的制御につながる結合」を探索するバイオインフォマティクス手法を開発しました。
哺乳类の细胞において、遗伝情报は染色体顿狈础から搁狈础に転写され、さらに様々な転写?転写后制御を受けることが知られています。搁狈础の制御を行う分子は搁狈础结合タンパク质と呼ばれ、ヒトで1500种类以上が存在することが知られています。搁狈础の制御は、复雑な遗伝子発现制御を必要とする哺乳类で特に重要であり、その异常がさまざまな疾患を引き起こすことが知られています。一方、それぞれの搁狈础结合タンパク质が数万种类の搁狈础のうちどれをどう制御するのかが大きな谜となっています。
本研究で开発された手法により、観察されていた236,000箇所以上の结合部位のうち、标的分子を决定する际に重要な役割を持つと考えられる约200箇所の同定に成功しました。これは、复雑な搁狈础制御のメカニズムおよびその包括的制御の全容解明や、搁狈础制御异常により引き起こされる疾患の治疗法开発につながる成果です。
本研究成果は、2020年6月27日に、国际学术誌「颈厂肠颈别苍肠别」に掲载されました。
図:本研究の概要図
详しい研究内容について
书誌情报
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KeiI IDA, Masatoshi Hagiwara, Akihide Takeuchi (2020). Multilateral Bioinformatics Analyses Reveal the Function-Oriented Target Specificities and Recognition of the RNA-Binding Protein SFPQ. iScience, 23(7):101325.